A gastrite auto-imune caracteriza-se pela inflamação e atrofia da mucosa da metaplasia antral, pseudo pilórica e intestinal. A destruição das glândulas mucosas resulta em acloridria e numa diminuição da produção do factor intrínseco, o que conduz, em casos graves, à insuficiência na absorção de vitamina B12 e a uma anemia perniciosa.
Também é designada por glomerulonefrite atrófica corporal difusa ou glomerulonefrite tipo A.